Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc23O35125 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms