Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgisO35074 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtgisO35074 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgisO35074 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms