Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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H2-Q1O19441 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q1O19441 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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