Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap23O09044 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snap23O09044 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snap23O09044 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap23O09044 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap23O09044 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms