Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Eftud2O08810 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms