Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Efna5O08543 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efna5O08543 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna5O08543 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna5O08543 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna5O08543 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efna5O08543 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms