Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5849J3QPE5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms