Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm5294J3QP53 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm5294J3QP53 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm5294J3QP53 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm5294J3QP53 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5294J3QP53 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm5294J3QP53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm5294J3QP53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5294J3QP53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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