Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm21900J3QP38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm21900J3QP38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21900J3QP38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21900J3QP38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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