Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pot1bH7BX60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms