Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms