Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b1G5E829 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms