Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nccrp1G3X9C2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms