Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8909G3UXE9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8909G3UXE9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8909G3UXE9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8909G3UXE9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8909G3UXE9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm8909G3UXE9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8909G3UXE9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8909G3UXE9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms