Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r167G3UW71 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r167G3UW71 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms