Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm16519F8VQK7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm16519F8VQK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16519F8VQK7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16519F8VQK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16519F8VQK7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16519F8VQK7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm16519F8VQK7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm16519F8VQK7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms