Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29094F6Q785 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms