Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4E9QAP7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4E9QAP7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4E9QAP7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Taf4E9QAP7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Taf4E9QAP7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4E9QAP7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms