Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cald1E9QA15 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms