Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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