Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt78E9Q0F0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms