Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms