Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms