Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb3D3Z6J4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms