Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc8D3YZV8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms