Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd1D3YXK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd1D3YXK1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms