Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mterf1bB9EJ57 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mterf1bB9EJ57 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms