Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rd3lB2RV38 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms