Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rrn3B2RS91 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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