Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr2B1AVP0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Phactr2B1AVP0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms