Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms