Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm438B1ASB3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms