Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms