Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms