Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syndig1A2ANU3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syndig1A2ANU3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syndig1A2ANU3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms