Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c4A2ANA3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c4A2ANA3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms