Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Frmpd1A2AKB4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms