Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms