Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C87977A2A958 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87977A2A958 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87977A2A958 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87977A2A958 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
C87977A2A958 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87977A2A958 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C87977A2A958 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C87977A2A958 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87977A2A958 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87977A2A958 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms