Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef6A2A8M8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pramef6A2A8M8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pramef6A2A8M8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef6A2A8M8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef6A2A8M8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef6A2A8M8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef6A2A8M8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef6A2A8M8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms