Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calcoco2A2A6M5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms