Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms