Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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