Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXZ4

Ighv1-62-2, Immunoglobulin heavy variable 1-62-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms