Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20792A0A087WRF5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20792A0A087WRF5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms