Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib2Q9Z309 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cib2Q9Z309 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms