Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms