Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms