Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Skp2Q9Z0Z3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp2Q9Z0Z3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms