Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms